Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms