Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLTPP55058 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms