Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HCCSP53701 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCCSP53701 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCCSP53701 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCCSP53701 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCCSP53701 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCCSP53701 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCCSP53701 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCCSP53701 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCCSP53701 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCCSP53701 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCCSP53701 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCCSP53701 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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