Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HK3P52790 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HK3P52790 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HK3P52790 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HK3P52790 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HK3P52790 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HK3P52790 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HK3P52790 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HK3P52790 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HK3P52790 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HK3P52790 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HK3P52790 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HK3P52790 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HK3P52790 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HK3P52790 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms