Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms