Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms