Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms