Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms