Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms