Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms