Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSSP25774 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms