Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRR1P24046 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRR1P24046 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRR1P24046 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRR1P24046 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRR1P24046 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRR1P24046 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRR1P24046 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRR1P24046 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRR1P24046 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRR1P24046 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRR1P24046 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRR1P24046 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRR1P24046 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms