Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms