Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms