Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms