Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms