Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA5P08648 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms