Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F13BP05160 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F13BP05160 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F13BP05160 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F13BP05160 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
F13BP05160 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F13BP05160 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F13BP05160 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F13BP05160 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms