Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APODP05090 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APODP05090 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APODP05090 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APODP05090 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms