Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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