Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GJB6O95452 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms