Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRATO95237 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRATO95237 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRATO95237 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms