Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP9O75884 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.6 ms