Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F6O75461 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F6O75461 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms