Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CNOT3O75175 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms