Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DENRO43583 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DENRO43583 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms