Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DHHO43323 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DHHO43323 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms