Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms