Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms