Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms