Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM1B2RUZ4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms