Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms