Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBAL3A6NHL2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms