Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRAP3Q9Y2W1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms