Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms