Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms