Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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