Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms