Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms