Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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