Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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