Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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