Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms