Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMLHEQ9NVH6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms