Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms