Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms