Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms