Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms