Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRCC1Q9NPI7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRCC1Q9NPI7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms