Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms